استهل المركز برامجه في مجال التدريب في عام 1981. و دأب منذ ذلك التاريخ على تنظيم دورات تدريبية/ورشات عمل قصيرة في مجالات مختارة تهم البلدان الأعضاء في منظمة المؤتمر الإسلامي، بالتعاون مع معاهد ومؤسسات تدريبية وطنية وإقليمية ودولية إلى جانب الوكالات المتخصصة التابعة لمنظمة الأمم المتحدة، وخصوصا منها منظمة الأغذية والزراعة (الفاو) التي ما فتئت تقدم له الدعم الفني لإنجاز العديد من الدورات التدريبية وورشات العمل. ولنشاطات المركز في مجال التدريب جانبا آخر ذا أهمية متزايدة وهو تعيين متدربين يختارهم المركز بمعرفته للالتحاق ببرامج تدريبية تنظمها مؤسسات مختارة في البلدان الأعضاء.

نظم المركز إلى الآن 63 دورة وورشة عمل تدريبية اشترك فيها أكثر من 1000 متدرب. ومن بين ما تميزت به تلك الدورات انخفاض تكلفتها مقارنة بمثيلاتها التي تنظمها منظمات دولية أخرى.

وفي هذا الإطار يدعو المركزُ المؤسسات الوطنية والإقليمية والدولية ذات العلاقة للاشتراك معه في تنظيم برامج و/أو ورشات عمل تدريبية حول المواضيع ذات الاهتمام المشترك، على أساس المشاركة في التكاليف، وهو يرحب بكل مقترح تتقدم به أي مؤسسة راغبة في مثل ذلك التعاون الذي ما من شك في أنه سيثري المهارات التخصصية للخبراء العاملين في دول المنظمة وسيلعب دورا هاما في الارتقاء بمستوى رأس مالها البشري.